Соревнования в Суперлиге <эА> в сезоне 2008/09 проводятся в два этапа.
I этап - XV Чемпионат <эБаскетбольной Суперлиги>. Сроки проведения: с 10 октября 2008 года по 5 апреля 2009 года. Команды играют в два круга с разъездами по одной игре дома и на выезде (каждая команда проводит 22 игры).
II этап - XVIII Чемпионат России. Сроки проведения: с 15 апреля 2009 года по 31 мая 2009 года. По результатам игр Чемпионата <эБаскетбольной Суперлиги> команды, занявшие с 1 по 8 места, образуют финальную группу и классифицируются под номерами соответственно 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 для участия в финальных соревнованиях Чемпионата России.
Порядок проведения игр в финальной группе по системе <эплей-офф>:
1/4 финала проводятся до двух побед по схеме 1+1+1, где 1-я и, при необходимости, последняя игра проводятся на площадке команд, указанных первыми в сетке плей-офф.
1/2 финала, финал и финал за 3-е место проводятся до трех побед по схеме 2+2+1. 1-я, 2-я игры и, при необходимости, 5-я игра проводятся на площадке команд, указанных первыми, 3-я и, при необходимости, 4-я игры - на площадке команд, указанных вторыми;
команды, проигравшие в 1/4 финала, разыгрывают места с 5 по 8 до двух побед по схеме 1+1+1, где 1-я и, при необходимости, последняя игра проводятся на площадке команд, указанных первыми в сетке плей-офф.
Команды, занявшие 9-12 места в Чемпионате <эБаскетбольной Суперлиги>, играют в рамках Чемпионата России в два круга с разъездами по одной игре дома и на выезде (каждая команда проводит 8 игр) с учетом всех набранных ранее очков. Команды, занявшие в Дивизионе <эА> в рамках Чемпионата России в сезоне 2008/09 места с 10-го по 12-е, будут выступать в сезоне 2009/10 в Дивизионе <эБ>. В состав участников Дивизиона <эА> Баскетбольной Суперлиги в сезоне 2009/10 будет включены только 10 клубов.